Microbes Intestin Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte
UMR 1071 Inserm / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- +33 4 73 17 79 97
- Sur Internet :
- m2ish.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Nicolas BARNICH
- Gestionnaire d'unité
- Magalie BLANCHETON magalie.blancheton@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 57 )
- ANDRE Marc -
- AUMAITRE Olivier -
- BONNET Richard -
- BUISSON Anthony -
- DELMAS Julien -
- GAGNIERE Johan -
- GODFRAIND Catherine -
- NOURRISSON Celine -
- PEZET Denis -
- POIRIER Philippe -
- ROBIN Frederic -
- BARNICH Nicolas -
- BHAUMIK Moumita -
- BILLARD Elisabeth -
- BONNET Mathilde -
- BOUCHER Delphine -
- DALMASSO Guillaume -
- DENIZOT Jeremy -
- LIVRELLI Valerie -
- NGUYEN Hang -
- BEYROUTHY Racha -
- FAURE Frederic -
- HOANG Thi My Hanh -
- SAUVANET Pierre -
- BEYROUTI Malak -
- CHEVARIN Caroline -
- COUDRAY Florian -
- CROUZILLAC Chloe -
- DUVAL Angeline -
- LECLAIRE Charlotte -
- RODRIGUES Michael -
- BECHON DIOT Celine -
- BLANCHETON Magalie -
- BODIER Nathan -
- BONNIN Virginie -
- FABRE Gwenaelle -
- GUILLOUARD Laurent -
- LEBEAU Sandra -
- MARTIN Lucas -
- MICHAUX Arnaud -
- MOREL Severine -
- OBLETTE Zoe -
- REZARD Alexandra -
- BOTCHORICHVILI Helene -
- DAMBRINE Flavie -
- DE CLERCQ Fanny -
- DESSEUX Coline -
- DEVAUX Amandine -
- FARGEAS Margot -
- JUBAN Charline -
- ONZON Meline -
- VERCRUYSSE Leslie -
- BIRER Aurelien -
- GAU Laurence -
- JOUBERT Morgane -
- MARTIN JARY Marine -
- MAURIN Eugenie -
Thèmes de Recherche
Version Française English version Un dialogue permanent s’établit dans le tube digestif entre le micobiote et l’hôte et tout déséquilibre de cette symbiose est à l’origine de nombreuses pathologies. L’UMR 1071 Inserm/université d’Auvergne mène depuis une dizaine d’années des travaux consistant à analyser la relation bactéries-hôte en étudiant les Escherichia coli pathogènes impliqués dans les maladies inflammatoires chroniques du tube digestif, en particulier la maladie de Crohn (MC) et les E. coli entérohémorragiques responsables de diarrhées aiguës et de syndrome hémolytique et urémique. Nous avons plus particulièrement été pionniers dans la mise en évidence que la muqueuse iléale des patients atteints de MC était anormalement colonisée par Escherichia coli. Notre hypothèse est que le développement de la MC pourrait être lié à une susceptibilité génétique des patients à être colonisés par les souches pathogènes de Escherichia coli (adherent-invasive E. coli ou AIEC) qui sont capables d’adhérer et de promouvoir leur internalisation dans les cellules épithéliales intestinales, de survivre et de se multiplier dans les cellules macrophagiques. De plus, en raison du lien fort qui existe entre inflammation chronique et cancer, nous avons également ouvert un nouveau sujet d’étude concernant la piste infectieuse à E. coli dans le développement de cancer colorectal.
Nous développons principalement trois axes de recherche : (i) exploration de la virulence de Escherichia coli responsables de pathologies inflammatoires intestinales, (ii) étude de la prédisposition de l’hôte à l’infection par E. coli dans la maladie de Crohn et le cancer colorectal, et (iii) développement de nouvelles thérapies spécifiques.
There is an ongoing dialogue in the digestive tract between microbiota and the host. Any imbalance in this symbiosis leads to many diseases, such as chronic inflammatory bowel diseases, colorectal cancer, obesity, metabolic syndrome. For the last ten years, the research unit “Microbes, Intestine, Inflammation and Host Susceptibility”, UMR 1071 Inserm/Université d’Auvergne, INRA USC 2018, has been studying the relationship between intestinal microbiota and the host, particularly the involvement of pathogenic Escherichia coli in chronic inflammatory bowel diseases, focusing on Crohn's disease and the role of enterohemmoragic E. coli involved in acute diarrhea and hemolytic uremic syndrome. This research unit is pioneer in demonstrating that the ileal mucosa of patients with Crohn's disease was abnormally colonized by pathogenic adherent-invasive Escherichia coli due to genetic susceptibility of Crohn’s disease patients with increased expression of intestinal receptor allowing E. coli colonization and/or with defects in autophagy, a cellular process allowing host cells to eliminate any intracellular pathogens. In addition, due to the strong link between chronic inflammation and cancer, this research unit also studies the link between modifications of the intestinal microbiota and colorectal cancer.
This unit is currently developing three areas of research: (i) exploration of the virulence of Escherichia coli responsible for chronic inflammatory bowel diseases and colorectal cancer, (ii) analysis of the host susceptibility to develop Crohn's disease or colorectal cancer, and (iii) design of new specific therapies.
Publications ( HAL )
- Panel gene profiling of small bowel adenocarcinoma: Results from the NADEGE prospective cohort
Thomas Aparicio , Magali Svrcek , Julie Henriques , Pauline Afchain , Astrid Lièvre , David Tougeron , Johan Gagniere , Eric Terrebonne , Guillaume Piessen , Jean‐louis Legoux , Cédric Lecaille , Marc Pocard , Jean‐marc Gornet , Aziz Zaanan , Sandrine Lavau-Denes , Thierry Lecomte , David Deutsch , Dewi Vernerey , Pierre Laurent Puig - Non-occlusive Small Bowel Ischemia Related to Postoperative Feeding Jejunostomy Tube Use After Esophagectomy for Cancer: Propensity Score Analysis of the AFC-FREGAT Database
J. Veziant , J. Gagnière , C. Gronnier , C. Mariette , S. Tzedakis , D. Fuks , G. Piessen , Guillaume Luc , Magalie Cabau , Jacques Jougon , Bogdan Badic , Patrick Lozach , Serge Cappeliez , Gil Lebreton , Arnaud Alves , Renaud Flamein , Denis Pezet , Federica Pipitone , Bogdan Stan Iuga , Nicolas Contival - Outcomes Associated With Esophageal Perforation Management
Julie Veziant , Fabio Boudis , Xavier Lenne , Amelie Bruandet , Clarisse Eveno , Frederiek Nuytens , Guillaume Piessen - Esophageal cancer - French intergroup clinical practice guidelines for diagnosis, treatments and follow-up (TNCD, SNFGE, FFCD, GERCOR, UNICANCER, SFCD, SFED, SFRO, ACHBT, SFP, RENAPE, SNFCP, AFEF, SFR)
Julie Veziant , Olivier Bouché , T. Aparicio , M. Barret , F. El Hajbi , V. Lepilliez , P. Lesueur , P. Maingon , D. Pannier , L. Quero , J.L. Raoul , F. Renaud , J.F. Seitz , A.A. Serre , E. Vaillant , M. Vermersch , T. Voron , D. Tougeron , Guillaume Piessen - Total Versus Subtotal Gastrectomy for Distal Gastric Poorly Cohesive Carcinoma
Mehdi Boubaddi , Hugo Teixeira Farinha , Céline Lambert , Bruno Pereira , Guillaume Piessen , Monica Gualtierotti , Thibault Voron , Styliani Mantziari , Denis Pezet , Caroline Gronnier , Jean-Marc Regimbeau , Baptiste Brac , Emilie Lermite , Julien Barbieux , Elodie Cloche , Pierre Gueroult , Serban Puia-Negulsecu , Olivier Degrandi , Camille Joumaa , Martin Seel - Évaluation des facteurs de virulence associés aux Escherichia coli producteurs de colibactine dans le cancer colorectal.
Héloïse Chat - Parasites and diet as main drivers of the Malagasy gut microbiome richness and function
Stanislas Mondot , Philippe Poirier , Ahmed Abou-Bacar , Valentin Greigert , Julie Brunet , Céline Nourrisson , Milijaona Randrianarivelojosia , Jean-Louis Razafindrakoto , Eugene Morel , Rivo Rakotomalala , Marion Leclerc , Karine Le Roux , Céline Monot , Ermanno Candolfi , Patricia Lepage - Protocol for a partially nested randomised controlled trial to evaluate the effectiveness of the scleroderma patient-centered intervention network COVID-19 home-isolation activities together (SPIN-CHAT) program to reduce anxiety among at-risk scleroderma patients
Brett Thombs , Linda Kwakkenbos , Marie-Eve Carrier , Angelica Bourgeault , Lydia Tao , Sami Harb , Maria Gagarine , Danielle Rice , Laura Bustamante , Kelsey Ellis , Delaney Duchek , Yin Wu , Parash Mani Bhandari , Dipika Neupane , Andrea Carboni-Jiménez , Richard Henry , Ankur Krishnan , Ying Sun , Brooke Levis , Chen He - Half of Postoperative Deaths After Cytoreductive Surgery and Hyperthermic Intraperitoneal Chemotherapy Could be Preventable
Constance Houlzé-Laroye , Olivier Glehen , Olivia Sgarbura , Etienne Gayat , Isabelle Sourrouille , Jean-Jacques Tuech , Jean-Baptiste Delhorme , Frédéric Dumont , Cécilia Ceribelli , Koceila Amroun , Catherine Arvieux , David Moszkowicz , Nicolas Pirro , Jérémie Lefevre , Thomas Courvosier-Clement , Brice Paquette , Pascale Mariani , Denis Pezet , Charles Sabbagh , Williams Tessier - Case series of intestinal microsporidiosis in non-HIV patients caused by Encephalitozoon hellem
Céline Nourrisson , Samia Hamane , Julie Bonhomme , Marie-Fleur Durieux , Jean-Baptiste Foulquier , Sophie Lesthelle , Maxime Moniot , Marie-Elisabeth Bougnoux , Philippe Poirier , Franck Labbe , Yohann Le Govic , Anne Totet , Céline Damiani , Ludovic de Gentile , Jean-Philippe Lemoine , Anne Pauline Bellanger , Sandrine Houze , Nicolas Argy , Isabelle Accoceberry , Laurence Delhaes
Production scientifique depuis 2020
- Inhibiteurs glycosidiques de levures - 2021
Reconnaissance de l'excellence
- ERA-NET - 2008 COLIEVOL
- Bourses CURIE - 2011 MIRNA-AIEC
- ERA-NET - Pathogenomics
- ANR 2012 - STARLET
- ANR 2013 - Nutribiote
- ANR 2013 - COMeBACk