Microbes Intestin Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte
UMR 1071 Inserm / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- +33 4 73 17 79 97
- Sur Internet :
- m2ish.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Nicolas BARNICH
- Gestionnaire d'unité
- Magalie BLANCHETON magalie.blancheton@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 57 )
- ANDRE Marc -
- AUMAITRE Olivier -
- BONNET Richard -
- BUISSON Anthony -
- DELMAS Julien -
- GAGNIERE Johan -
- GODFRAIND Catherine -
- NOURRISSON Celine -
- PEZET Denis -
- POIRIER Philippe -
- ROBIN Frederic -
- BARNICH Nicolas -
- BHAUMIK Moumita -
- BILLARD Elisabeth -
- BONNET Mathilde -
- BOUCHER Delphine -
- DALMASSO Guillaume -
- DENIZOT Jeremy -
- LIVRELLI Valerie -
- NGUYEN Hang -
- BEYROUTHY Racha -
- FAURE Frederic -
- HOANG Thi My Hanh -
- SAUVANET Pierre -
- CHEVARIN Caroline -
- COUDRAY Florian -
- CROUZILLAC Chloe -
- DUVAL Angeline -
- LECLAIRE Charlotte -
- RODRIGUES Michael -
- BECHON DIOT Celine -
- BLANCHETON Magalie -
- BODIER Nathan -
- BONNIN Virginie -
- FABRE Gwenaelle -
- GUILLOUARD Laurent -
- LEBEAU Sandra -
- MARTIN Lucas -
- MICHAUX Arnaud -
- MOREL Severine -
- OBLETTE Zoe -
- REZARD Alexandra -
- BOTCHORICHVILI Helene -
- DAMBRINE Flavie -
- DE CLERCQ Fanny -
- DESSEUX Coline -
- DEVAUX Amandine -
- FARGEAS Margot -
- JOUBERT Morgane -
- JUBAN Charline -
- ONZON Meline -
- VERCRUYSSE Leslie -
- BIRER Aurelien -
- GAU Laurence -
- JOUBERT Morgane -
- MARTIN JARY Marine -
- MAURIN Eugenie -
Thèmes de Recherche
Version Française English version Un dialogue permanent s’établit dans le tube digestif entre le micobiote et l’hôte et tout déséquilibre de cette symbiose est à l’origine de nombreuses pathologies. L’UMR 1071 Inserm/université d’Auvergne mène depuis une dizaine d’années des travaux consistant à analyser la relation bactéries-hôte en étudiant les Escherichia coli pathogènes impliqués dans les maladies inflammatoires chroniques du tube digestif, en particulier la maladie de Crohn (MC) et les E. coli entérohémorragiques responsables de diarrhées aiguës et de syndrome hémolytique et urémique. Nous avons plus particulièrement été pionniers dans la mise en évidence que la muqueuse iléale des patients atteints de MC était anormalement colonisée par Escherichia coli. Notre hypothèse est que le développement de la MC pourrait être lié à une susceptibilité génétique des patients à être colonisés par les souches pathogènes de Escherichia coli (adherent-invasive E. coli ou AIEC) qui sont capables d’adhérer et de promouvoir leur internalisation dans les cellules épithéliales intestinales, de survivre et de se multiplier dans les cellules macrophagiques. De plus, en raison du lien fort qui existe entre inflammation chronique et cancer, nous avons également ouvert un nouveau sujet d’étude concernant la piste infectieuse à E. coli dans le développement de cancer colorectal.
Nous développons principalement trois axes de recherche : (i) exploration de la virulence de Escherichia coli responsables de pathologies inflammatoires intestinales, (ii) étude de la prédisposition de l’hôte à l’infection par E. coli dans la maladie de Crohn et le cancer colorectal, et (iii) développement de nouvelles thérapies spécifiques.
There is an ongoing dialogue in the digestive tract between microbiota and the host. Any imbalance in this symbiosis leads to many diseases, such as chronic inflammatory bowel diseases, colorectal cancer, obesity, metabolic syndrome. For the last ten years, the research unit “Microbes, Intestine, Inflammation and Host Susceptibility”, UMR 1071 Inserm/Université d’Auvergne, INRA USC 2018, has been studying the relationship between intestinal microbiota and the host, particularly the involvement of pathogenic Escherichia coli in chronic inflammatory bowel diseases, focusing on Crohn's disease and the role of enterohemmoragic E. coli involved in acute diarrhea and hemolytic uremic syndrome. This research unit is pioneer in demonstrating that the ileal mucosa of patients with Crohn's disease was abnormally colonized by pathogenic adherent-invasive Escherichia coli due to genetic susceptibility of Crohn’s disease patients with increased expression of intestinal receptor allowing E. coli colonization and/or with defects in autophagy, a cellular process allowing host cells to eliminate any intracellular pathogens. In addition, due to the strong link between chronic inflammation and cancer, this research unit also studies the link between modifications of the intestinal microbiota and colorectal cancer.
This unit is currently developing three areas of research: (i) exploration of the virulence of Escherichia coli responsible for chronic inflammatory bowel diseases and colorectal cancer, (ii) analysis of the host susceptibility to develop Crohn's disease or colorectal cancer, and (iii) design of new specific therapies.
Publications ( HAL )
- Anti-TNFα therapy for chronic inflammatory disease in kidney transplant recipients
Cyril Garrouste , Dany Anglicheau , Nassim Kamar , Claire Bachelier , Joseph Rivalan , Bruno Pereira , Sophie Caillard , Julien Aniort , Philippe Gatault , Martin Soubrier , Johnny Sayegh , Charlotte Colosio , Anthony Buisson , Eric Thervet , Nicolas Bouvier , Anne Elisabeth Heng - Demystifying BRAF Mutation Status in Colorectal Liver Metastases
Georgios Margonis , Thomas Boerner , Jean-Baptiste Bachet , Stefan Buettner , Roberto Moretto , Nikolaos Andreatos , Andrea Sartore-Bianchi , Jane Wang , Carsten Kamphues , Johan Gagniere , Sara Lonardi , Inger Løes , Doris Wagner , Andrea Spallanzani , Kazunari Sasaki , Richard Burkhart , Filippo Pietrantonio , Emmanouil Pikoulis , Timothy Pawlik , Stéphanie Truant - Demystifying BRAF Mutation Status in Colorectal Liver Metastases
Georgios Margonis , Thomas Boerner , Jean-Baptiste Bachet , Stefan Buettner , Roberto Moretto , Nikolaos Andreatos , Andrea Sartore-Bianchi , Jane Wang , Carsten Kamphues , Johan Gagniere , Sara Lonardi , Inger Løes , Doris Wagner , Andrea Spallanzani , Kazunari Sasaki , Richard Burkhart , Filippo Pietrantonio , Emmanouil Pikoulis , Timothy Pawlik , Stéphanie Truant - The colibactin-producing Escherichia coli alters the tumor microenvironment to immunosuppressive lipid overload facilitating colorectal cancer progression and chemoresistance
Nilmara de Oliveira Alves , Guillaume Dalmasso , Darja Nikitina , Amaury Vaysse , Richard Ruez , Lea Ledoux , Thierry Pedron , Emma Bergsten , Olivier Boulard , Lora Autier , Sofian Allam , Laurence Motreff , Pierre Sauvanet , Diane Letourneur , Pragya Kashyap , Johan Gagnière , Denis Pezet , Catherine Godfraind , Michel Salzet , Emmanuel Lemichez - Reg3A and glycerophospholipids metabolites axis promote an immune-suppressive microenvironment in right-sided colon cancer
Nilmara de Oliveira Alves , Amaury Vaysse , Guillaume Dalmasso , Olivier Boulard , Thomas Paz del Socorro , Pierre Sauvanet , Lionel Franz Poulin , Iradj Sobhani , Richard Bonnet , Mathias Chamaillard - Expression of KRAS mutation and loss of a c-type lectin cooperates to sustain a bacterial-induced immune-suppressive microenvironment in right-sided colon cancer.
Nilmara de Oliveira Alves , Amaury Vaysse , Guillaume Dalmasso , Olivier Boulard , Pierre Sauvanet , Lionel Franz Poulin , Iradj Sobhani , Richard Bonnet , Mathias Chamaillard - Étude de la reconnaissance des Escherichia coli adhérents et invasifs (AIEC) associés à la maladie de Crohn par l'autophagie : identification des récepteurs autophagiques et des facteurs de virulence
Alison da Silva - Spatially-resolved metabolomic identifies a reprogramming of lipid metabolism and immune surveillance that are caused by colibactin-producing E. coli infection.
Nilmara de Oliveira Alves , Amel Mettouchi , Guillaume Dalmasso , Amaury Vaysse , Emma Bergsten , Diane Letourneur , Catherine Godfraind , Christophe Malabat , Marc Monot , Emmanuel Lemichez , Pierre Sauvanet , Nicolas Barnich , Sean P Kennedy , Richard Bonnet , Iradj Sobhani , Mathias Chamaillard - Spatial metabolomics reveals a reprogramming of lipid metabolism by bacterial colibactin supporting immunosuppressive microenvironment in right-sided colon cancer
Nilmara de Oliveira Alves , Olivier Boulard , Amaury Vaysse , Guillaume Dalmasso , Darja Nikitina , Richard Ruez , Léa Ledoux , Thierry Pedron , Emma Bergsten , Lora Autier , Sofian Allam , Laurence Motreff , Pierre Sauvanet , Diane Letourneur , Johan Gagnière , Denis Pezet , Catherine Godfraind , Isabelle Fournier , Michel Salzet , Imène Najjar - Bacterial colibactin-induced lipid accumulation and loss of a c-type lectin cooperates for supporting an immune-suppressive microenvironment in right-sided colon cancer
Nilmara de Oliveira Alves , Amaury Vaysse , Guillaume Dalmasso , Darja Nikitina , Olivier Boulard , Pierre Sauvanet , Lionel Franz Poulin , Sean P Kennedy , Iradj Sobhani , Richard Bonnet , Mathias Chamaillard
Production scientifique depuis 2020
- Inhibiteurs glycosidiques de levures - 2021
Reconnaissance de l'excellence
- ERA-NET - 2008 COLIEVOL
- Bourses CURIE - 2011 MIRNA-AIEC
- ERA-NET - Pathogenomics
- ANR 2012 - STARLET
- ANR 2013 - Nutribiote
- ANR 2013 - COMeBACk