Description

MetaboHUB est une infrastructure nationale pour la métabolomique et la fluxomique qui fournit des outils analytiques et des services aux équipes de recherche académiques et aux partenaires industriels dans les domaines de la nutrition, de la santé, de l’agriculture, de l’environnement et des biotechnologies.


Objectifs scientifiques et développement technologiques

L’infrastructure MetaboHUB est un projet d’enjeu scientifique et technologique qui vise à dépasser les verrous scientifiques et techniques actuels en métabolomique et fluxomique pour :

  • fournir des technologies analytiques semi-quantitatives standardisées et/ou quantitatives couplées à des méthodes bioinformatiques de traitement des données pour le phénotypage biochimique à haut débit de grands ensembles d’échantillons (cohortes humaines, larges populations de plantes transgéniques ou non, micro-organismes, etc.) et pour la biologie des systèmes,
  • identifier des métabolites dans les liquides biologiques humains, les extraits de plantes, les microorganismes et les extraits de cellules animales, grâce à la mise en œuvre et la maintenance de bases de données de spectres de référence pour les annotations du métabolome,
  • développer des mesures de flux à haut débit (échelle cellulaire et subcellulaire) grâce à l’intégration de données analytiques provenant de plusieurs appareils d’analyse,
  • fournir un accès à des services à forte valeur ajoutée à la communauté scientifique nationale et aux acteurs industriels, et diffuser les connaissances (transfert technologique, communication scientifique, formation).

Services offerts

MetaboHUB fournit :

  • des analyses complémentaires aux autres technologies « omiques » pour soutenir les approches de biologie des systèmes,
  • les moyens pour identifier des biomarqueurs pertinents pour la nutrition et la médecine personnalisée, indispensables pour le diagnostic des maladies (ex : obésité, cancer, maladies cardio-vasculaires, pathologies neurologiques, etc)
  • des indicateurs de stress et les biomarqueurs utiles pour les programmes d’élevage et les pratiques agricoles,
  • de nouveaux outils analytiques et de nouvelles stratégies pour optimiser l’ingénierie métabolique microbienne afin de proposer de nouvelles voies de synthèse de molécules d’intérêt industriel.

De plus, MetaboHUB contribue à l’effort international pour l’annotation, lanormalisation des méthodes d’analyse du métabolome, et la construction de base de données.
Partenaires :

  • INRA (Porteur et coordinateur),
  • CEA (porteur),
  • CNRS,
  • INSAT,
  • INSERM,
  • Université de Bordeaux,
  • Université Clermont Auvergne (Clermont-Ferrand)/Plate-Forme Exploration du Métabolisme (PFEM),
  • Université Paul Sabatier (Toulouse),
  • Université Pierre et Marie Curie (Paris)