Laboratoire de Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales

UMR 1095 / UCA

Adresse :
Site Crouël

5, Chemin de Beaulieu
63039 CLERMONT-FERRAND
Tél :
+ 33 4 43 76 15 34
Sur Internet :
www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
Adresse :
Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
Tél :
+ 33 4 43 76 15 34
Sur Internet :
www6.clermont.inrae.fr/umr1095/

Responsables

Directeur de laboratoire
Jerome SALSE
Directeur Adjoint
Pierre BARRET
Directeur Adjoint
Jacques LE GOUIS
Directrice Adjointe
Catherine RAVEL
Gestionnaire d'unité
Laetitia COUDERT laetitia.coudert@uca.fr

Composition équipe ( effectif total : 87 )

Enseignant-chercheur universitaire (7)
  • BONHOMME Ludovic -
  • BOUDET Julie -
  • MARLIAC Gaelle -
  • MOUZEYAR Said -
  • PIQUET Agnes -
  • ROCHE EYHERAGUIBEL Jane -
  • STEVENS Aurelia -
Chercheur (12)
  • ALLARD Vincent -
  • BLANCON Justin -
  • BOUCHET Sophie -
  • CHARMET Gilles -
  • CIVAN Peter -
  • LANGIN Thierry -
  • LE GOUIS Jacques -
  • LECARPENTIER Christophe -
  • SAINTENAC Cyrille -
  • SALSE Jerome -
  • SANO Naoto -
  • SOURDILLE Pierre -
Ingénieur de recherche (titulaires et contractuels) (8)
  • BARRET Pierre -
  • BOUGUENNEC Annaig -
  • CHOULET Frederic -
  • GIROUSSE Christine -
  • OURY Francois Xavier -
  • PONCET Charles -
  • PONT POULET Caroline -
  • RAVEL Catherine -
Ingénieur d'étude / asi (titulaires et contractuels) (22)
  • BANCEL Emmanuelle -
  • BEAUVOIR Julien -
  • BERNARD Stephane -
  • BRUN Lea -
  • CALVAYRAC Catherine -
  • CAMBON Florence -
  • CARRIAS DELOCHE Marion -
  • COSTON Amelie -
  • DEBITON Clement -
  • FAYE Annie -
  • GAUTIER Veronique -
  • GEORGES Ludovic -
  • LASSERRE ZUBER Pauline -
  • LELOUP Fabien -
  • LESSERTEUR Lea -
  • MERLINO Marielle -
  • NADAUD Isabelle -
  • PARTIER Anne -
  • PERROCHON Sibille -
  • RANOUX Marion -
  • RIMBERT Helene -
  • TIXIER LEYRE Patricia -
Post-doc et chercheurs contractuels (2)
  • MARIN Pierre -
  • OZTURK Hasret -
Technicien / administratif (titulaires et contractuels) (25)
  • ALVAREZ David -
  • ASAR Nese -
  • BARDY Lionel -
  • BARGOIN Kevin -
  • BENEDIT Stephane -
  • BERNARD Nathalie -
  • BLANC Richard -
  • BOYER Delphine -
  • CONFOLENT Carole -
  • COUDERT Laetitia -
  • DENEFLE Michael -
  • DUPUITS Celine -
  • GOBEBIEWSKI Julie -
  • HUNEAU Cecile -
  • JAFFRELO Lydia -
  • KITT Jonathan -
  • LHOMMET Isabelle -
  • MAGNAUDET Julien -
  • MARCON Dominique -
  • MARTIGNAC Valerie -
  • MENECIER Clara -
  • PHILIPPE Geraldine -
  • ROUGEOL Severine -
  • SAUVAT Stephane -
  • TASSY Caroline -
Doctorant (11)
  • AHCHOUCH Fatima Zahra -
  • BACON Antoine -
  • BANOUH Meriem -
  • DHANASEKARAN Padmapriya -
  • FREY Caroline -
  • GUILLOU Clement -
  • HAQUET Camille -
  • MAGLIARASCHI Ninon -
  • RODRIGUES DE ARAUJO ALVES CRUZ Laila -
  • SANGATA Rosie -
  • UNVERICHT Marie -

Equipes

  • Génétique et Recombinaison (GeCO) , Pierre SOURDILLE
  • Centre de Ressources Biologiques (CRB) , Francois BALFOURIER
  • Cultures des Plantes en Conditions Contrôlées (CPCC) , Stephane BERNARD
  • Diversité et Génomes (DiGen) , Etienne PAUX
  • La Variance comme source de Stabilité (VISTA) , Vincent ALLARD
  • Maladies des céréales (MDC) , Thierry LANGIN
  • Paléogénomique et Evolution (PaléoEvo) , Jerome SALSE
  • Plateforme de Bioinformatique (BIOINFO) , Frederic CHOULET
  • Plateforme de Transgénèse du Blé (ValFon) , Pierre BARRET
  • Plateforme de séquençage et genotypage (Gentyane) , Charles PONCET
  • Qualité des grains (QualiGrain) , Jacques LE GOUIS

Thèmes de Recherche

L’Unité Mixte de Recherche Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales (UMR 1095 GDEC) associe l’INRAE (Départements scientifiques BAP, AgroEnv, SPE, Centre Clermont Auvergne – Rhône-Alpes) et l’Université Clermont-Auvergne (UFR de Biologie, Collegium « Sciences de la Vie, Santé, Environnement »). Localisée sur le site Inrae de Crouël (Clermont-Fd) et sur le Campus Universitaire des Cézeaux (Aubière), elle compte 80 permanents (68  Inra, 8 UCA, 3 VAS, 1 CNRS) et 30 à 40 non permanents (Doctorants, Post-Doctorants, CDD, visiteurs). Elle est rattachée à l’Ecole Doctorale 65 Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement, et impliquée dans différentes formations, dont le Master de Biologie Végétale Plant Integrative Biology & Breeding (PIBB) et le Master de Microbiologie.

Les projets, développés au sein de 6 équipes de recherche aux thématiques interconnectées, sont focalisés sur le blé tendre, espèce modèle et d’importance agronomique (2ème céréale au niveau mondial). A l’interface entre recherche fondamentale et recherche finalisée, leur objectif commun est l’amélioration de la qualité et du rendement du blé dans un contexte de transition agroécologique et de changements climatiques, avec comme principaux objectifs : (1) Progresser dans la connaissance de la structure, de l’organisation, du fonctionnement et de l’évolution du génome du blé tendre, comprendre la genèse de nouvelles fonctions et/ou l’évolution de fonctions conservées spécifiques au cours de l’histoire évolutive du blé et plus largement des céréales. (2) Décrypter et modéliser les mécanismes moléculaires et physiologiques impliqués dans le contrôle de caractères agronomiques importants tels que rendement, qualité du grain et résistance/tolérance à des stress biotiques (maladies) ou abiotiques (déficience en azote, en soufre, changements climatiques, …). (3) Analyser et valoriser les ressources génétiques, (4) Contribuer au développement de nouveaux outils et méthodes de sélection (Sélection génomique), et intégrer les connaissances acquises dans des modèles pour améliorer l’efficacité de la sélection variétale. Ces projets s’inscrivent dans les objectifs du Challenge 1 « Concevoir et piloter des agroécosystèmes durables dans un contexte de changement global » du projet I-SITE Clermont CAP 20-25.

L’UMR GDEC dispose d’infrastructures expérimentales dotées des équipements les plus récents : Plateforme Stratégique Nationale Gentyane (Séquençage et génotypage haut débit), Plateforme de Validation Fonctionnelle (transgénèse blés, collections de mutants, Genome Editing), Plateforme de production de matériel végétal en conditions contrôlées (enceintes et chambres climatiques, 1300 m2 de serres conventionnelles, 1000 m2 de serres S2), Centre de Ressources Biologiques Céréales à paille (~27000 accessions), Plateforme de Bioinformatique, Service d’Appui (gestion administrative, financière, RH). Les expérimentations en plein champ sont réalisées en collaboration avec l’Unité Expérimentale INRAE PHACC, l’UMR et l’UE assurant la gestion de la Plateforme de Phénotypage haut débit Pheno3C, qui permet l’étude en condition de plein champ des interactions génotype x environnement, et de tester l’impact de paramètres clefs du changement climatique (stress hydrique, [CO2] atmosphérique).

Considérée aujourd’hui comme un leader incontournable en génomique et génétique des céréales au niveau international, l’UMR GDEC a développé un réseau très dense de collaborations avec des partenaires académiques et privés.

Publications ( HAL )

Production scientifique depuis 2021

Brevets (1)
  • Polymère superabsorbant bioactif, son procédé de fabrication et ses utilisations - 2024

Reconnaissance de l'excellence