Laboratoire de Génétique, Diversité, Écophysiologie des Céréales
UMR 1095 / UCA
- Adresse :
- Site Crouël
5, Chemin de Beaulieu
63039 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- + 33 4 43 76 15 34
- Sur Internet :
- www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- + 33 4 43 76 15 34
- Sur Internet :
- www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Jerome SALSE
- Directeur Adjoint
- Pierre BARRET
- Directeur Adjoint
- Jacques LE GOUIS
- Directrice Adjointe
- Catherine RAVEL
- Gestionnaire d'unité
- Laetitia COUDERT laetitia.coudert@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 86 )
- BONHOMME Ludovic -
- BOUDET Julie -
- MARLIAC Gaelle -
- MOUZEYAR Said -
- PIQUET Agnes -
- ROCHE EYHERAGUIBEL Jane -
- STEVENS Aurelia -
- ALLARD Vincent -
- BLANCON Justin -
- BOUCHET Sophie -
- CHARMET Gilles -
- CIVAN Peter -
- LANGIN Thierry -
- LE GOUIS Jacques -
- LECARPENTIER Christophe -
- SAINTENAC Cyrille -
- SALSE Jerome -
- SANO Naoto -
- SOURDILLE Pierre -
- BARRET Pierre -
- BOUGUENNEC Annaig -
- CHOULET Frederic -
- GIROUSSE Christine -
- OURY Francois Xavier -
- PONCET Charles -
- PONT POULET Caroline -
- RAVEL Catherine -
- BANCEL Emmanuelle -
- BEAUVOIR Julien -
- BERNARD Stephane -
- CALVAYRAC Catherine -
- CAMBON Florence -
- COSTON Amelie -
- DEBITON Clement -
- FAYE Annie -
- GAUTIER Veronique -
- LASSERRE ZUBER Pauline -
- LELOUP Fabien -
- LESSERTEUR Lea -
- MERLINO Marielle -
- NADAUD Isabelle -
- PARTIER Anne -
- RANOUX Marion -
- RIMBERT Helene -
- TIXIER LEYRE Patricia -
- MARIN Pierre -
- OZTURK Hasret -
- ALVAREZ David -
- BARDY Lionel -
- BARGOIN Kevin -
- BENEDIT Stephane -
- BERNARD Nathalie -
- BLANC Richard -
- BOYER Delphine -
- CARRIAS DELOCHE Marion -
- CONFOLENT Carole -
- COUDERT Laetitia -
- DENEFLE Michael -
- DUPUITS Celine -
- GEORGES Ludovic -
- GOBEBIEWSKI Julie -
- HUNEAU Cecile -
- JAFFRELO Lydia -
- KITT Jonathan -
- LHOMMET Isabelle -
- MAGNAUDET Julien -
- MARCON Dominique -
- MARTIGNAC Valerie -
- MENECIER Clara -
- PERROCHON Sibille -
- PHILIPPE Geraldine -
- ROUGEOL Severine -
- SAUVAT Stephane -
- TASSY Caroline -
- AHCHOUCH Fatima Zahra -
- BACON Antoine -
- BANOUH Meriem -
- DHANASEKARAN Padmapriya -
- DUPONT Maxime -
- FREY Caroline -
- GUILLOU Clement -
- HAQUET Camille -
- MAGLIARASCHI Ninon -
- RODRIGUES DE ARAUJO ALVES CRUZ Laila -
- SANGATA Rosie -
- UNVERICHT Marie -
Equipes
- Génétique et Recombinaison (GeCO) , Pierre SOURDILLE
- Centre de Ressources Biologiques (CRB) , Francois BALFOURIER
- Cultures des Plantes en Conditions Contrôlées (CPCC) , Stephane BERNARD
- Diversité et Génomes (DiGen) , Etienne PAUX
- La Variance comme source de Stabilité (VISTA) , Vincent ALLARD
- Maladies des céréales (MDC) , Thierry LANGIN
- Paléogénomique et Evolution (PaléoEvo) , Jerome SALSE
- Plateforme de Bioinformatique (BIOINFO) , Frederic CHOULET
- Plateforme de Transgénèse du Blé (ValFon) , Pierre BARRET
- Plateforme de séquençage et genotypage (Gentyane) , Charles PONCET
- Qualité des grains (QualiGrain) , Jacques LE GOUIS
Thèmes de Recherche
L’Unité Mixte de Recherche Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales (UMR 1095 GDEC) associe l’INRAE (Départements scientifiques BAP, AgroEnv, SPE, Centre Clermont Auvergne – Rhône-Alpes) et l’Université Clermont-Auvergne (UFR de Biologie, Collegium « Sciences de la Vie, Santé, Environnement »). Localisée sur le site Inrae de Crouël (Clermont-Fd) et sur le Campus Universitaire des Cézeaux (Aubière), elle compte 80 permanents (68 Inra, 8 UCA, 3 VAS, 1 CNRS) et 30 à 40 non permanents (Doctorants, Post-Doctorants, CDD, visiteurs). Elle est rattachée à l’Ecole Doctorale 65 Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement, et impliquée dans différentes formations, dont le Master de Biologie Végétale Plant Integrative Biology & Breeding (PIBB) et le Master de Microbiologie.
Les projets, développés au sein de 6 équipes de recherche aux thématiques interconnectées, sont focalisés sur le blé tendre, espèce modèle et d’importance agronomique (2ème céréale au niveau mondial). A l’interface entre recherche fondamentale et recherche finalisée, leur objectif commun est l’amélioration de la qualité et du rendement du blé dans un contexte de transition agroécologique et de changements climatiques, avec comme principaux objectifs : (1) Progresser dans la connaissance de la structure, de l’organisation, du fonctionnement et de l’évolution du génome du blé tendre, comprendre la genèse de nouvelles fonctions et/ou l’évolution de fonctions conservées spécifiques au cours de l’histoire évolutive du blé et plus largement des céréales. (2) Décrypter et modéliser les mécanismes moléculaires et physiologiques impliqués dans le contrôle de caractères agronomiques importants tels que rendement, qualité du grain et résistance/tolérance à des stress biotiques (maladies) ou abiotiques (déficience en azote, en soufre, changements climatiques, …). (3) Analyser et valoriser les ressources génétiques, (4) Contribuer au développement de nouveaux outils et méthodes de sélection (Sélection génomique), et intégrer les connaissances acquises dans des modèles pour améliorer l’efficacité de la sélection variétale. Ces projets s’inscrivent dans les objectifs du Challenge 1 « Concevoir et piloter des agroécosystèmes durables dans un contexte de changement global » du projet I-SITE Clermont CAP 20-25.
L’UMR GDEC dispose d’infrastructures expérimentales dotées des équipements les plus récents : Plateforme Stratégique Nationale Gentyane (Séquençage et génotypage haut débit), Plateforme de Validation Fonctionnelle (transgénèse blés, collections de mutants, Genome Editing), Plateforme de production de matériel végétal en conditions contrôlées (enceintes et chambres climatiques, 1300 m2 de serres conventionnelles, 1000 m2 de serres S2), Centre de Ressources Biologiques Céréales à paille (~27000 accessions), Plateforme de Bioinformatique, Service d’Appui (gestion administrative, financière, RH). Les expérimentations en plein champ sont réalisées en collaboration avec l’Unité Expérimentale INRAE PHACC, l’UMR et l’UE assurant la gestion de la Plateforme de Phénotypage haut débit Pheno3C, qui permet l’étude en condition de plein champ des interactions génotype x environnement, et de tester l’impact de paramètres clefs du changement climatique (stress hydrique, [CO2] atmosphérique).
Considérée aujourd’hui comme un leader incontournable en génomique et génétique des céréales au niveau international, l’UMR GDEC a développé un réseau très dense de collaborations avec des partenaires académiques et privés.
Publications ( HAL )
- ADONIS® WebApp & Mobile - Acquisition des DonnéeS à INRAE version application Web
Audrey Palain-Saint-Agathe , Vincent Dumas , Fabien Surault , Antoine Jacque , Aurélien Bernard , Jérôme Didier , Laurent Falchetto , Guillaume Bodineau , David Alletru , Julien Parmentier , David Lanoue , Frédéric Bernier , Philippe Clastre , Jean Gauvin , Eric Duchêne , Pascal Bertin , Philippe Burger , Lecomte Alain - Growing intermediate wheatgrass as a perennial grain crop in the United States: exploring the multifunctionality of agriculture within socio-technical constraints
Christelle Ginot , Erica Shoenberger , Valentin D Picasso , Olivier Duchene - Pan1c (Pangenome at chromosome level)
Alexis Mergez , Martin Racoupeau , Christophe Klopp , Christine Gaspin , Fabrice Legeai , Frédéric Choulet - Développements méthodologiques et applications en biologie translationnelle de techniques d'édition du génome chez le blé tendre
Maxime Kadner - DéLiBéRé-JNO : Développement de Lignées de Blé adaptées et Résistantes à la Jaunisse Nanisante (JNO)- FSOV 2018-D
Edouard Penez , Philippe Momont , Charles Snijders , Anne-Charlotte Lombart , Pascal Giraudeau , Romain Lamerand , Gemma Molero , Patrice Senellart , Sylvie Dutriez , Matthieu Michel , Raphael Vequaud , Paul Forgeois , Charlotte Thibaut , Torsten Will , Pierre Sourdille - DéLiBéRé-JNO : Développement de Lignées de Blé adaptées et Résistantes à la Jaunisse Nanisante (JNO)Projet FSOV 2018-D
Edouard Penez , Philippe Momont , Charles Snijders , Anne-Charlotte Lombart , Pascal Giraudeau , Romain Lamerand , Gemma Molero , Patrice Senellart , Sylvie Dutriez , Matthieu Michel , Raphael Vequaud , Paul Forgeois , Charlotte Thibaut , Torsten Will , Pierre Sourdille - In Silico Root Trait Phenotyping for Maize in C-K Deficit and Toxic Conditions Using Convolutional Neural Networks.
Jane J. Roche - Environmental footprints of legumes-based agroecosystems for sustainable development
Agnès Piquet - Septoria tritici blotch resistance gene Stb15 encodes a lectin receptor-like kinase
Amber Hafeez , Laetitia Chartrain , Cong Feng , Florence Cambon , Martha Clarke , Simon Griffiths , Sadiye Hayta , Mei Jiang , Beat Keller , Rachel Kirby , Markus Kolodziej , Oliver Powell , Mark Smedley , Burkhard Steuernagel , Wenfei Xian , Luzie Wingen , Shifeng Cheng , Cyrille Saintenac , Brande Wulff , James Brown - Effective Nitrogen Use in Wheat: A Multi‐Environment Trial Comparison of Nitrogen Utilization Efficiency Versus Nutrition Index
Josefina Lacasa , Jacques Le Gouis , Francesca Degan , Gilles Lemaire , Ignacio Ciampitti
Production scientifique depuis 2021
- Polymère superabsorbant bioactif, son procédé de fabrication et ses utilisations - 2024