Nature UE
Crédits ECTS 6
Volume horaire total 50
Volume horaire CM 7
Volume horaire TD 4
Volume horaire TP 39

Pré-requis

Aucun pré-requis.

Objectifs

• Connaitre les principaux serveurs dédiés à l’analyse des génomes • Apprendre à utiliser des bases de données pour intégrer des données massives et hétérogènes • Initiation au travail d’équipe • Comprendre le principe et savoir utiliser des outils bio-informatiques dédiés à l’analyse de séquences • Apprendre à construire une chaine de traitement efficace • Utiliser une sélection de langages de programmation utilisés en bioinformatique (Python, Bash)

Contenu

COURS MAGISTRAUX ( 12 H)

Initiation à l'algorithmie à travers les points suivants :
• Constantes et variables
• Instructions élémentaires
• Expressions et opérateurs
• Structures de contrôle
• Fonctions et procédures
• Tableaux et tableaux associatifs
• Pointeurs
• Gestion des fichiers
Introduction au langage de programmation Python

TRAVAUX PRATIQUES ( 39 H)

• Pratique du langage de programmation Python (32 h de TP)
• variables, structures de contrôles, …
• développement et test de programmes
• Projet Individuel (6h de suivi)
• le même projet sera réalisé par chaque étudiant
• Le projet est à rendre sous la forme d'un programme Python bien commenté

Appartient à

Informations complémentaires

• Connaitre les principaux serveurs dédiés à l’analyse des génomes • Apprendre à utiliser des bases de données pour intégrer des données massives et hétérogènes • Initiation au travail d’équipe • Comprendre le principe et savoir utiliser des outils bio-informatiques dédiés à l’analyse de séquences • Apprendre à construire une chaine de traitement efficace • Utiliser une sélection de langages de programmation utilisés en bioinformatique (Python, Bash)