Laboratoire de Génétique, Diversité, Écophysiologie des Céréales
UMR 1095 / UCA
- Adresse :
- Site Crouël
5, Chemin de Beaulieu
63039 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- + 33 4 43 76 15 34
- Sur Internet :
- www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- + 33 4 43 76 15 34
- Sur Internet :
- www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Jerome SALSE
- Directeur Adjoint
- Pierre BARRET
- Directeur Adjoint
- Jacques LE GOUIS
- Directrice Adjointe
- Catherine RAVEL
- Gestionnaire d'unité
- Laetitia COUDERT laetitia.coudert@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 100 )
- Enseignant-chercheur universitaire (7)
-
- BONHOMME Ludovic -
- BOUDET Julie -
- CHARRA VASKOU Katline -
- MARLIAC Gaelle -
- MOUZEYAR Said -
- ROCHE EYHERAGUIBEL Jane -
- STEVENS Aurelia -
- Chercheur (10)
-
- ALLARD Vincent -
- BLANCON Justin -
- BOUCHET Sophie -
- CIVAN Peter -
- LE GOUIS Jacques -
- LECARPENTIER Christophe -
- SAINTENAC Cyrille -
- SALSE Jerome -
- SANO Naoto -
- SOURDILLE Pierre -
- Ingénieur de recherche (titulaires et contractuels) (15)
-
- BARRET Pierre -
- BEAUVOIR Julien -
- BORJAS ESQUEDA Aldo Daniel -
- BOUGUENNEC Annaig -
- CHERON Floriane -
- CHOULET Frederic -
- DUFLOS Remi -
- GIROUSSE Christine -
- MARIN Pierre -
- MOREAU Carol -
- PAIRE Laura -
- PONCET Charles -
- POULET Caroline -
- RAVEL Catherine -
- STENGER Pierre Louis -
- Ingénieur d'étude / asi (titulaires et contractuels) (25)
-
- BANCEL Emmanuelle -
- BELMONTE Elodie -
- BERNARD Stephane -
- BOTY BI Lauryn -
- BRUN Lea -
- CALVAYRAC Catherine -
- CAMBON Florence -
- CARRIAS DELOCHE Marion -
- CHRONOWSKI Vanessa -
- DEBITON Clement -
- FAYE Annie -
- GAUTIER Veronique -
- GEORGES Ludovic -
- LASSERRE ZUBER Pauline -
- LELOUP Fabien -
- LESSERTEUR Lea -
- MARTIN Sabine -
- MERLINO Marielle -
- PARTIER Anne -
- PERROCHON Sibille -
- PITARCH Anais -
- RANOUX Marion -
- RIMBERT Helene -
- TIXIER LEYRE Patricia -
- YOUNCHA Ali -
- Post-doc et chercheurs contractuels (2)
-
- BONTO Aldrin -
- ROCHER Florian -
- Technicien / administratif (titulaires et contractuels) (28)
-
- ALVAREZ David -
- BARDY Lionel -
- BARGOIN Kevin -
- BENEDIT Stephane -
- BERNARD Nathalie -
- BLANC Richard -
- BOUQUET Romain -
- BOYER Delphine -
- BRESSON Amelie -
- CONFOLENT Carole -
- COUDERT Laetitia -
- DENEFLE Michael -
- DUPUITS Celine -
- GARRAUD Lucy -
- GOLEBIEWSKI Julie -
- GONZALEZ Tiffanie -
- GOUTTEFANGEAS Stephanie -
- HUNEAU Cecile -
- JAFFRELO Lydia -
- KITT Jonathan -
- LHOMMET Isabelle -
- MAGNAUDET Julien -
- MARTIGNAC Valerie -
- MENECIER Clara -
- PHILIPPE Geraldine -
- ROUGEOL Severine -
- SAUVAT Stephane -
- TASSY Caroline -
- Doctorant (12)
-
- AHCHOUCH Fatima Zahra -
- BACON Antoine -
- DHANASEKARAN Padmapriya -
- GUACANEME MORENO Martin -
- GUILLOU Clement -
- HAQUET Camille -
- LANGLET Clementine -
- MURRELL Kathryn -
- PUAUD Savinien -
- RODRIGUES DE ARAUJO ALVES CRUZ Laila -
- SANGATA Rosie -
- UNVERICHT Marie -
- Autre personnel (1)
-
- TEXERAUD Emeric -
Equipes
- Génétique et Recombinaison (GeCO) , Pierre SOURDILLE
- Centre de Ressources Biologiques (CRB) , Francois BALFOURIER
- Cultures des Plantes en Conditions Contrôlées (CPCC) , Stephane BERNARD
- Diversité et Génomes (DiGen) , Etienne PAUX
- La Variance comme source de Stabilité (VISTA) , Vincent ALLARD
- Maladies des céréales (MDC) , Thierry LANGIN
- Paléogénomique et Evolution (PaléoEvo) , Jerome SALSE
- Plateforme de Bioinformatique (BIOINFO) , Frederic CHOULET
- Plateforme de Transgénèse du Blé (ValFon) , Pierre BARRET
- Plateforme de séquençage et genotypage (Gentyane) , Charles PONCET
- Qualité des grains (QualiGrain) , Jacques LE GOUIS
Thèmes de Recherche
L’Unité Mixte de Recherche Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales (UMR 1095 GDEC) associe l’INRAE (Départements scientifiques BAP, AgroEnv, SPE, Centre Clermont Auvergne – Rhône-Alpes) et l’Université Clermont-Auvergne (UFR de Biologie, Collegium « Sciences de la Vie, Santé, Environnement »). Localisée sur le site Inrae de Crouël (Clermont-Fd) et sur le Campus Universitaire des Cézeaux (Aubière), elle compte 80 permanents (68 Inra, 8 UCA, 3 VAS, 1 CNRS) et 30 à 40 non permanents (Doctorants, Post-Doctorants, CDD, visiteurs). Elle est rattachée à l’Ecole Doctorale 65 Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement, et impliquée dans différentes formations, dont le Master de Biologie Végétale Plant Integrative Biology & Breeding (PIBB) et le Master de Microbiologie.
Les projets, développés au sein de 6 équipes de recherche aux thématiques interconnectées, sont focalisés sur le blé tendre, espèce modèle et d’importance agronomique (2ème céréale au niveau mondial). A l’interface entre recherche fondamentale et recherche finalisée, leur objectif commun est l’amélioration de la qualité et du rendement du blé dans un contexte de transition agroécologique et de changements climatiques, avec comme principaux objectifs : (1) Progresser dans la connaissance de la structure, de l’organisation, du fonctionnement et de l’évolution du génome du blé tendre, comprendre la genèse de nouvelles fonctions et/ou l’évolution de fonctions conservées spécifiques au cours de l’histoire évolutive du blé et plus largement des céréales. (2) Décrypter et modéliser les mécanismes moléculaires et physiologiques impliqués dans le contrôle de caractères agronomiques importants tels que rendement, qualité du grain et résistance/tolérance à des stress biotiques (maladies) ou abiotiques (déficience en azote, en soufre, changements climatiques, …). (3) Analyser et valoriser les ressources génétiques, (4) Contribuer au développement de nouveaux outils et méthodes de sélection (Sélection génomique), et intégrer les connaissances acquises dans des modèles pour améliorer l’efficacité de la sélection variétale. Ces projets s’inscrivent dans les objectifs du Challenge 1 « Concevoir et piloter des agroécosystèmes durables dans un contexte de changement global » du projet I-SITE Clermont CAP 20-25.
L’UMR GDEC dispose d’infrastructures expérimentales dotées des équipements les plus récents : Plateforme Stratégique Nationale Gentyane (Séquençage et génotypage haut débit), Plateforme de Validation Fonctionnelle (transgénèse blés, collections de mutants, Genome Editing), Plateforme de production de matériel végétal en conditions contrôlées (enceintes et chambres climatiques, 1300 m2 de serres conventionnelles, 1000 m2 de serres S2), Centre de Ressources Biologiques Céréales à paille (~27000 accessions), Plateforme de Bioinformatique, Service d’Appui (gestion administrative, financière, RH). Les expérimentations en plein champ sont réalisées en collaboration avec l’Unité Expérimentale INRAE PHACC, l’UMR et l’UE assurant la gestion de la Plateforme de Phénotypage haut débit Pheno3C, qui permet l’étude en condition de plein champ des interactions génotype x environnement, et de tester l’impact de paramètres clefs du changement climatique (stress hydrique, [CO2] atmosphérique).
Considérée aujourd’hui comme un leader incontournable en génomique et génétique des céréales au niveau international, l’UMR GDEC a développé un réseau très dense de collaborations avec des partenaires académiques et privés.
Publications ( HAL )
- Alimentation et exploitation des plantes à l’Âge du Bronze (2100 – 800 av. n. è.) autour des lacs d’Annecy et du Bourget : étude carpologique
Marie Lelièvre , Manon Cabanis , Yves Billaud , Carol Moreau , Éric Néré , Caroline Pont , Laurent Bouby - Effects of plant density on canopy development and reproductive behavior of intermediate wheatgrass
Christelle Ginot , Benjamin Dumont , Vincent Allard , Douglas J Cattani , Thierry Langin , Christophe David , Olivier Duchene - Blé, riz, maïs : toute l'histoire
Jean-Baptiste Veyrieras , Caroline Pont , Jérôme Salse - Reconstruction of ancestral plant genomes for inter-crop translational research
Cléa Siguret , Margaux Olivier , Cécile Huneau , Mamadou Dia Sow , Pierre-Louis Stenger , Christophe Klopp , Marie-Laure Martin , Jean-Philippe Tamby , Sergueï Gorbounov , Raphaël Flores , Fabrice Legeai , Matéo Boudet , Raffaella Battaglia , Davide Guerra , Peter Civan , Caroline Pont , Anne-Françoise Adam-Blondon , Luigi Cattivelli , Olivier Mathieu , Jérôme Salse - Ancient wheat DNA: How and what for?
Caroline Pont , Pierre-Louis Stenger , Carol Moreau , Cécile Huneau , Marie Lelièvre , Jerome Salse - Agriculture : connaissez-vous le Paléolab, un outil pour prédire l’avenir ?
Sandrine Montéro , Caroline Pont , Carol Moreau - La domestication des plantes
Jérôme Salse - Les blés du passé sont-ils l’avenir ?
Jérôme Salse - Ouverture du laboratoire PaleoLab pour l'étude de l'ADN ancien des restes archéobotaniques (29 mars 2023)
Caroline Pont , Manon Cabanis , Jérôme Salse - Reconstruction of wheat origins and evolutionary trajectories from modern and ancient DNA
Caroline Pont , Caroline Schaal , Manon Cabanis , Jérôme Salse
Production scientifique depuis 2022
- Polymère superabsorbant bioactif, son procédé de fabrication et ses utilisations - 2024