Microbes Intestin Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte

UMR 1071 Inserm / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- +33 4 73 17 79 97
- Sur Internet :
- m2ish.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Nicolas BARNICH
- Gestionnaire d'unité
- Magalie BLANCHETON magalie.blancheton@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 58 )
- ANDRE Marc -
- AUMAITRE Olivier -
- BONNET Richard -
- BUISSON Anthony -
- DELMAS Julien -
- GAGNIERE Johan -
- GODFRAIND Catherine -
- NOURRISSON Celine -
- PEZET Denis -
- POIRIER Philippe -
- ROBIN Frederic -
- BARNICH Nicolas -
- BILLARD Elisabeth -
- BONNET Mathilde -
- BOUCHER Delphine -
- DALMASSO Guillaume -
- DENIZOT Jeremy -
- LIVRELLI Valerie -
- NGUYEN Hang -
- BEYROUTHY Racha -
- FAURE Frederic -
- HOANG Thi My Hanh -
- LOLLIVIER Emilie -
- BEYROUTI Malak -
- CHEVARIN Caroline -
- COUDRAY Florian -
- CROUZILLAC Chloe -
- DUVAL Angeline -
- PROUST Simon -
- ROCHE Gwenaelle -
- SAUVANET Pierre -
- BECHON DIOT Celine -
- BLANCHETON Magalie -
- BODIER Nathan -
- BONNIN Virginie -
- GUILLOUARD Laurent -
- LEBEAU Sandra -
- MARTIN Lucas -
- MICHAUX Arnaud -
- MOREL Severine -
- OBLETTE Zoe -
- REZARD Alexandra -
- RODRIGUES Michael -
- BOTCHORICHVILI Helene -
- CHAT Heloise -
- DA SILVA Alison -
- DAMBRINE Flavie -
- DE CLERCQ Fanny -
- DESSEUX Coline -
- DEVAUX Amandine -
- FARGEAS Margot -
- JUBAN Charline -
- ONZON Meline -
- TREFOND Ludovic -
- VERCRUYSSE Leslie -
- BIRER Aurelien -
- MARTIN JARY Marine -
- MAURIN Eugenie -
Thèmes de Recherche
Version Française English version Un dialogue permanent s’établit dans le tube digestif entre le micobiote et l’hôte et tout déséquilibre de cette symbiose est à l’origine de nombreuses pathologies. L’UMR 1071 Inserm/université d’Auvergne mène depuis une dizaine d’années des travaux consistant à analyser la relation bactéries-hôte en étudiant les Escherichia coli pathogènes impliqués dans les maladies inflammatoires chroniques du tube digestif, en particulier la maladie de Crohn (MC) et les E. coli entérohémorragiques responsables de diarrhées aiguës et de syndrome hémolytique et urémique. Nous avons plus particulièrement été pionniers dans la mise en évidence que la muqueuse iléale des patients atteints de MC était anormalement colonisée par Escherichia coli. Notre hypothèse est que le développement de la MC pourrait être lié à une susceptibilité génétique des patients à être colonisés par les souches pathogènes de Escherichia coli (adherent-invasive E. coli ou AIEC) qui sont capables d’adhérer et de promouvoir leur internalisation dans les cellules épithéliales intestinales, de survivre et de se multiplier dans les cellules macrophagiques. De plus, en raison du lien fort qui existe entre inflammation chronique et cancer, nous avons également ouvert un nouveau sujet d’étude concernant la piste infectieuse à E. coli dans le développement de cancer colorectal.
Nous développons principalement trois axes de recherche : (i) exploration de la virulence de Escherichia coli responsables de pathologies inflammatoires intestinales, (ii) étude de la prédisposition de l’hôte à l’infection par E. coli dans la maladie de Crohn et le cancer colorectal, et (iii) développement de nouvelles thérapies spécifiques.
There is an ongoing dialogue in the digestive tract between microbiota and the host. Any imbalance in this symbiosis leads to many diseases, such as chronic inflammatory bowel diseases, colorectal cancer, obesity, metabolic syndrome. For the last ten years, the research unit “Microbes, Intestine, Inflammation and Host Susceptibility”, UMR 1071 Inserm/Université d’Auvergne, INRA USC 2018, has been studying the relationship between intestinal microbiota and the host, particularly the involvement of pathogenic Escherichia coli in chronic inflammatory bowel diseases, focusing on Crohn's disease and the role of enterohemmoragic E. coli involved in acute diarrhea and hemolytic uremic syndrome. This research unit is pioneer in demonstrating that the ileal mucosa of patients with Crohn's disease was abnormally colonized by pathogenic adherent-invasive Escherichia coli due to genetic susceptibility of Crohn’s disease patients with increased expression of intestinal receptor allowing E. coli colonization and/or with defects in autophagy, a cellular process allowing host cells to eliminate any intracellular pathogens. In addition, due to the strong link between chronic inflammation and cancer, this research unit also studies the link between modifications of the intestinal microbiota and colorectal cancer.
This unit is currently developing three areas of research: (i) exploration of the virulence of Escherichia coli responsible for chronic inflammatory bowel diseases and colorectal cancer, (ii) analysis of the host susceptibility to develop Crohn's disease or colorectal cancer, and (iii) design of new specific therapies.
Publications ( HAL )
- Invasive fungal diseases in patients with autoimmune diseases: a case series from the French RESSIF network
Simon Galmiche , Benjamin Thoreau , Stéphane Bretagne , Alexandre Alanio , André Paugam , Valérie Letscher-Bru , Sophie Cassaing , Jean-Pierre Gangneux , Hélène Guegan , Loïc Favennec , Alida Minoza , Florent Morio , Julie Bonhomme , Guillaume Desoubeaux , Odile Eloy , Lilia Hasseine , Milène Sasso , Laurence Millon , Anne-Pauline Bellanger , Philippe Poirier - Serpin-positive Bifidobacterium breve CNCM I-5644 improves intestinal permeability in two models of irritable bowel syndrome
Edgar Torres-Maravilla , Sophie Holowacz , Johanne Delannoy , Loïc Lenoir , Elsa Jacouton , Sandie Gervason , Maëva Meynier , Anne-Sophie Boucard , Frédéric Carvalho , Frédéric Barbut , Luis Bermúdez-Humarán , Philippe Langella , Anne-Judith Waligora-Dupriet - Prevalence of and factors associated with extraintestinal manifestations and their remission in inflammatory bowel disease: the EXTRA prospective study from the GETAID
Lucas Guillo , Guillaume Savoye , Aurélien Amiot , Cyrielle Gilletta , Maria Nachury , Nina Dib , Arnaud Bourreille , Xavier Roblin , Ludovic Caillo , Matthieu Allez , Laurence Picon , Xavier Hébuterne , Philippe Seksik , Antoine Chupin , Anthony Buisson , Hédia Brixi , Romain Altwegg , Marion Simon , Morgane Amil , David Laharie - The Secretome landscape of Escherichia coli O157:H7: Deciphering the cell-surface, outer membrane vesicle and extracellular subproteomes
Ricardo Monteiro , Ingrid Chafsey , Valentin Ageorges , Sabine Leroy , Christophe Chambon , Michel Hébraud , Valérie Livrelli , Mariagrazia Pizza , Alfredo Pezzicoli , Mickael M. Desvaux - Adherent-invasive E. coli – induced specific IgA limits pathobiont localization to the epithelial niche in the gut
Rika Tanaka , Jin Imai , Hitoshi Tsugawa , Karl Bil Eap , Masaki Yazawa , Motoki Kaneko , Masashi Ohno , Kohei Sugihara , Sho Kitamoto , Hiroko Nagao-Kitamoto , Nicolas Barnich , Masashi Matsushima , Takayoshi Suzuki , Tatehiro Kagawa , Yasuhiro Nishizaki , Hidekazu Suzuki , Nobuhiko Kamada , Katsuto Hozumi - Impact of HIV Infection on the Course of Inflammatory Bowel Disease and Drug Safety Profile: A Multicenter GETAID Study
Lucas Guillo , Mathieu Uzzan , Laurent Beaugerie , Jean-Marc Gornet , Aurélien Amiot , Anne-Laure Pelletier , Romain Altwegg , David Laharie , Vered Abitbol , Jérôme Filippi , Felix Goutorbe , Maria Nachury , Stéphane Nancey , Stéphanie Viennot , Catherine Reenaers , Morgane Amil , Ludovic Caillo , Anthony Buisson , Michael Collins , Laurence Picon - Genotypic Characteristics and Antimicrobial Resistance of Escherichia coli ST141 Clonal Group
Audrey Emery , Didier Hocquet , Richard Bonnet , Xavier Bertrand - Obesity in adult patients with inflammatory bowel disease: Clinical features and impact on disability. A cross-sectional survey from the GETAID
Rose Al Bacha , Yoram Bouhnik , Melanie Serrero , Jerome Filippi , Xavier Roblin , Anne Bourrier , Guillaume Bouguen , Denis Franchimont , Guillaume Savoye , Anthony Buisson , Edouard Louis , Stephane Nancey , Vered Abitbol , Jean-Marie Reimund , Olivier Dewit , Lucine Vuitton , Nicolas Mathieu , Laurent Peyrin-Biroulet , Cyrielle Gilletta , Matthieu Allez - Dynamics of extended-spectrum cephalosporin resistance genes in Escherichia coli from Europe and North America
Roxana Zamudio , Patrick Boerlin , Racha Beyrouthy , Jean-Yves Madec , Stefan Schwarz , Michael R Mulvey , George G Zhanel , Ashley Cormier , Gabhan Chalmers , Richard Bonnet , Marisa Haenni , Inga Eichhorn , Heike Kaspar , Raquel Garcia-Fierro , James L N Wood , Alison E Mather - Etude de l’association du microbiote intestinal et des caractéristiques de composition corporelle sur les résultats postopératoires du cancer colorectal sporadique non métastatique
Julie Veziant
Production scientifique depuis 2019
- Inhibiteurs glycosidiques de levures - 2021
Reconnaissance de l'excellence
- ERA-NET - 2008 COLIEVOL
- Bourses CURIE - 2011 MIRNA-AIEC
- ERA-NET - Pathogenomics
- ANR 2012 - STARLET
- ANR 2013 - Nutribiote
- ANR 2013 - COMeBACk