Microbes Intestin Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte

UMR 1071 Inserm / UCA
- Adresse :
- UFR de Pharmacie / UFR de Médecine et des Professions paramédicales
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-FERRAND
- Tél :
- +33 4 73 17 79 97
- Sur Internet :
- m2ish.uca.fr
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Nicolas BARNICH
- Gestionnaire d'unité
- Magalie BLANCHETON magalie.blancheton@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 57 )
- ANDRE Marc -
- AUMAITRE Olivier -
- BONNET Richard -
- BUISSON Anthony -
- DELMAS Julien -
- GAGNIERE Johan -
- GODFRAIND Catherine -
- NOURRISSON Celine -
- PEZET Denis -
- POIRIER Philippe -
- ROBIN Frederic -
- BARNICH Nicolas -
- BILLARD Elisabeth -
- BONNET Mathilde -
- BOUCHER Delphine -
- DALMASSO Guillaume -
- DENIZOT Jeremy -
- LIVRELLI Valerie -
- NGUYEN Hang -
- BEYROUTHY Racha -
- FAURE Frederic -
- HOANG Thi My Hanh -
- LOLLIVIER Emilie -
- BEYROUTI Malak -
- CHERVY Melissa -
- CHEVARIN Caroline -
- COUDRAY Florian -
- CROUZILLAC Chloe -
- DUVAL Angéline -
- PROUST Simon -
- ROCHE Gwenaelle -
- SAUVANET Pierre -
- SIVIGNON Adeline -
- KAVANAUGH Devon -
- BECHON DIOT Celine Audrey -
- BLANCHETON Magalie -
- BODIER Nathan -
- BONNIN Virginie -
- GUILLOUARD Laurent -
- LEBEAU Sandra -
- MARTIN Lucas -
- MICHAUX Arnaud -
- REZARD Alexandra -
- RODRIGUES Michael -
- BOTCHORICHVILI Helene -
- CHAT Heloise -
- DA SILVA Alison -
- DAMBRINE Flavie -
- DE CLERCQ Fanny -
- DESSEUX Coline -
- DEVAUX Amandine -
- FARGEAS Margot -
- TREFOND Ludovic -
- VERCRUYSSE Leslie -
- BIRER Aurelien -
- MARTIN JARY Marine -
- MAURIN Eugenie -
Thèmes de Recherche
Version Française English version Un dialogue permanent s’établit dans le tube digestif entre le micobiote et l’hôte et tout déséquilibre de cette symbiose est à l’origine de nombreuses pathologies. L’UMR 1071 Inserm/université d’Auvergne mène depuis une dizaine d’années des travaux consistant à analyser la relation bactéries-hôte en étudiant les Escherichia coli pathogènes impliqués dans les maladies inflammatoires chroniques du tube digestif, en particulier la maladie de Crohn (MC) et les E. coli entérohémorragiques responsables de diarrhées aiguës et de syndrome hémolytique et urémique. Nous avons plus particulièrement été pionniers dans la mise en évidence que la muqueuse iléale des patients atteints de MC était anormalement colonisée par Escherichia coli. Notre hypothèse est que le développement de la MC pourrait être lié à une susceptibilité génétique des patients à être colonisés par les souches pathogènes de Escherichia coli (adherent-invasive E. coli ou AIEC) qui sont capables d’adhérer et de promouvoir leur internalisation dans les cellules épithéliales intestinales, de survivre et de se multiplier dans les cellules macrophagiques. De plus, en raison du lien fort qui existe entre inflammation chronique et cancer, nous avons également ouvert un nouveau sujet d’étude concernant la piste infectieuse à E. coli dans le développement de cancer colorectal.
Nous développons principalement trois axes de recherche : (i) exploration de la virulence de Escherichia coli responsables de pathologies inflammatoires intestinales, (ii) étude de la prédisposition de l’hôte à l’infection par E. coli dans la maladie de Crohn et le cancer colorectal, et (iii) développement de nouvelles thérapies spécifiques.
There is an ongoing dialogue in the digestive tract between microbiota and the host. Any imbalance in this symbiosis leads to many diseases, such as chronic inflammatory bowel diseases, colorectal cancer, obesity, metabolic syndrome. For the last ten years, the research unit “Microbes, Intestine, Inflammation and Host Susceptibility”, UMR 1071 Inserm/Université d’Auvergne, INRA USC 2018, has been studying the relationship between intestinal microbiota and the host, particularly the involvement of pathogenic Escherichia coli in chronic inflammatory bowel diseases, focusing on Crohn's disease and the role of enterohemmoragic E. coli involved in acute diarrhea and hemolytic uremic syndrome. This research unit is pioneer in demonstrating that the ileal mucosa of patients with Crohn's disease was abnormally colonized by pathogenic adherent-invasive Escherichia coli due to genetic susceptibility of Crohn’s disease patients with increased expression of intestinal receptor allowing E. coli colonization and/or with defects in autophagy, a cellular process allowing host cells to eliminate any intracellular pathogens. In addition, due to the strong link between chronic inflammation and cancer, this research unit also studies the link between modifications of the intestinal microbiota and colorectal cancer.
This unit is currently developing three areas of research: (i) exploration of the virulence of Escherichia coli responsible for chronic inflammatory bowel diseases and colorectal cancer, (ii) analysis of the host susceptibility to develop Crohn's disease or colorectal cancer, and (iii) design of new specific therapies.
Publications ( HAL )
- Serpin-positive Bifidobacterium breve CNCM I-5644 improves intestinal permeability in two models of irritable bowel syndrome
Edgar Torres-Maravilla , Sophie Holowacz , Johanne Delannoy , Loïc Lenoir , Elsa Jacouton , Sandie Gervason , Maëva Meynier , Anne-Sophie Boucard , Frédéric Carvalho , Frédéric Barbut , Luis Bermúdez-Humarán , Philippe Langella , Anne-Judith Waligora-Dupriet - Adalimumab in biologic-naïve patients with Crohn’s disease after resolution of an intra-abdominal abscess: a prospective study from the GETAID
Yoram Bouhnik , Guillaume Pineton de Chambrun , Jérôme Lambert , Maria Nachury , Philippe Seksik , Romain Altwegg , Lucine Vuitton , Carmen Stefanescu , Stéphane Nancey , Alexandre Aubourg , Mélanie Serrero , Jérôme Filippi , Kristell Desseaux , Stéphanie Viennot , Vered Abitbol , Madina Boualit , Arnaud Bourreille , Cyrielle Giletta , Anthony Buisson , Xavier Roblin - Positive margins and plexitis increase the risk of recurrence after ileocecal resection: A systematic review and meta-analysis
Clara Yzet , Clémentine Riault , Franck Brazier , Lucien Grados , Eric Nguyen-Khac , Denis Chatelain , Charles Sabbagh , Anthony Buisson , Momar Diouf , Mathurin Fumery - Correlation between DNA Methylation and cell proliferation identifies new candidate predictive markers in meningioma
Sébastien Hergalant , Chloé Saurel , Marion Divoux , Fabien Rech , Celso Pouget , Catherine Godfraind , Pierre Rouyer , Stéphanie Lacomme , Shyue-Fang Battaglia-Hsu , Guillaume Gauchotte - Mucolytic bacteria license pathobionts to acquire host-derived nutrients during dietary nutrient restriction
Kohei Sugihara , Sho Kitamoto , Prakaimuk Saraithong , Hiroko Nagao-Kitamoto , Matthew Hoostal , Caroline Mccarthy , Alexandra Rosevelt , Chithra Muraleedharan , Merritt Gillilland , Jin Imai , Maiko Omi , Shrinivas Bishu , John Kao , Christopher Alteri , Nicolas Barnich , Thomas Schmidt , Asma Nusrat , Naohiro Inohara , Jonathan Golob , Nobuhiko Kamada - An adherent-invasive Escherichia coli -colonized mouse model to evaluate microbiota-targeting strategies in Crohn's disease
Adeline Sivignon , Mélissa Chervy , Caroline Chevarin , Elia Ragot , Elisabeth Billard , Jérémy Denizot , Nicolas Barnich - Determination of biomarkers associated with neoadjuvant treatment response focusing on colibactin-producing Escherichia coli in patients with mid or low rectal cancer: a prospective clinical study protocol (MICARE)
Christophe Taoum , Guillaume Carrier , Marta Jarlier , Gwenaelle Roche , Johan Gagniere , Catherine Fiess , Helene de Forges , Caroline Chevarin , Pierre-Emmanuel Colombo , Nicolas Barnich , Philippe Rouanet , Mathilde Bonnet - Safety of Vaccination against SARS-CoV-2 in People with Rheumatic and Musculoskeletal Diseases: Results from the EULAR Coronavirus Vaccine (COVAX) Physician-Reported Registry
Pedro M Machado , Saskia Lawson-Tovey , Anja Strangfeld , Elsa F Mateus , Kimme L Hyrich , Laure Gossec , Loreto Carmona , Ana Rodrigues , Bernd Raffeiner , Catia Duarte , Eric Hachulla , Eric Veillard , Eva Strakova , Gerd R Burmester , Gözde Kübra Yardımcı , Jose A Gomez-Puerta , Julija Zepa , Lianne Kearsley-Fleet , Ludovic Trefond , Maria Cunha - Impact of HIV Infection on the Course of Inflammatory Bowel Disease and Drug Safety Profile: A Multicenter GETAID Study
Lucas Guillo , Mathieu Uzzan , Laurent Beaugerie , Jean-Marc Gornet , Aurélien Amiot , Anne-Laure Pelletier , Romain Altwegg , David Laharie , Vered Abitbol , Jérôme Filippi , Felix Goutorbe , Maria Nachury , Stéphane Nancey , Stéphanie Viennot , Catherine Reenaers , Morgane Amil , Ludovic Caillo , Anthony Buisson , Michael Collins , Laurence Picon - Evaluation of the Bio-Evolution Microsporidia generic and typing real-time PCR assays for the diagnosis of intestinal microsporidiosis
Maxime Moniot , Céline Nourrisson , Virginie Bonnin , Céline Damiani , Nicolas Argy , Julie Bonhomme , Emilie Fréalle , Cécile Angebault , Anne Debourgogne , Sitterle Emilie , Pierre Flori , Julie Brunet , Frédéric Dalle , Loïc Favennec , Philippe Poirier , French Microsporidiosis Network
Production scientifique depuis 2019
- Inhibiteurs glycosidiques de levures - 2021
Reconnaissance de l'excellence
- ERA-NET - 2008 COLIEVOL
- Bourses CURIE - 2011 MIRNA-AIEC
- ERA-NET - Pathogenomics
- ANR 2012 - STARLET
- ANR 2013 - Nutribiote
- ANR 2013 - COMeBACk